Schoubyes Sø er lille og lavvandet. Den har således kun en gennemsnitsdybde på ca. 0,8 meter med en maksimaldybde på 2,1 meter. Vandstanden svinger imidlertid ret kraftigt; således spirede der lyng på søbunden i de tørre somre midt i 1990’erne.
Schoubyes Sø indgår i EF-habitatområde nr. 181, som består af dele af skovene og søerne i Søhøjlandet syd og øst for Silkeborg.
==Litteratur==