Indtil midten af 1950’erne blev der ledt urenset spildevand ud i søen. Spildevandet er siden blevet afskåret, men der er fortsat regnvandsoverløb til søen.
Mod sydøst ligger skovfogedboligen [[Lyngsøhus]] (, Frederiksberggade 104), som naturligt har navn efter søen. Tidligere lå denne på adressen Frederiksberggade 82. På [[Bryndumsvej]] ligger [[Arbejdernes Andels-Boligforening]]s bebyggelse "[[Lyngsøgården]].
[[Lyngsøvej]] og [[Lyngsøvænget]] har navn også efter Lyngsø.