Øens navn kan føres tilbage til 1200-tallet, hvor Femø i kong Valdemars jordebog optræder under navnet Fymø eller Thymø, der betyder skum.
Femøvej ligger i kvarteret ved [[Funder Bakke]], hvor gaderne har navne efter [[Gadenavnegrupper: Øer i danske bælter og sunde | øer]] i danske bælter og sunde. Det drejer sig om gaderne: [[Askøvej]], [[Drejøvej]], [[Fejøvej]], Femøvej, [[Lyøvej]], [[Omøvej]], [[Skarøvej]], [[Sprogøvej]], [[Strynøvej]], [[Thurøvej]], [[Æbeløvej]] og [[Ærøvej]].
Femøvej hed før [[Gadenavnsændringer_i_Silkeborg|gadenavnereguleringen]] i oplandet i 1969 Lindealle.