I Danmark findes der 261 habitatområder, der er udpeget i perioden 1998-2010.
Områderne har et samlet areal på ca. 19.300 km², der er fordelt med 16.142km² som marine områder (svarende til 15,3 % af Danmarks havareal og 83,7 % af det samlede habitatareal) og ca. 3.173 km² på land (svarende til ca. 7,4 % af Danmarks landareal og 16,3% af det samlede habitatareal).
De naturtyper, der skal beskyttes, er dem:
Der er i fare for at forsvinde i deres naturlige udbredelsesområde
Der har et begrænset naturligt udbredelsesområde, fordi de er gået tilbage, eller fordi de fra naturens hånd er begrænsede
Der er karakteristiske for forskellige områder af Europa