Søerne udgør ca. 1/6 af habitatområdets areal. Det drejer sig om følgende søer: [[Almind Sø]], [[Avnsø]], [[Borre Sø]], [[Mørksø]], [[Pøt Sø]], [[Slåensø]], [[Thorsø]], [[Tranevig]], [[Tranevig Vældkilder]], [[Uglesø]] og [[Ørnsø]] samt [[Jenskær]] og [[Sokær]].
Den lysåbne natur udgør kun en meget lille del af området. I dalen mellem Vesterskoven Vesterskov og [[Rustrup Skov]] ligger kærområdet [[Jenskær]].
Både skov- og søområderne har stor rekreativ værdi og udnyttes ret intensivt til skovture og sejlads.