==Navnet ”Mørksø”==
Navnet "Mørksøe" optræder første gang på et matrikelkort fra 1793. Forleddet er adjektivet ”mørk”, som fomodentlig hentyder til søens sure, mørke vand. På ældre geodætiske kort synes navnet på søen at være Hoksmose.
==Nævnes af H. C. Andernsen==
I artiklen "Silkeborg" i Folkekalender for Danmark fra 1854 skriver H. C. Andersen og den store uberørte natur på vejen til Silkeborg - nybyggerbyen og han har følgende at berette om Mørksø:
''Vej- og stiløse skovstrækninger omslutter her dybe søer; på en af disse ses en lille svømmende ø med et enligt hældende træ, den driver om derude, hvorhen vinden fører den.'' ''Man fortæller, at en fremmed kom til et af disse vande, den såkaldte Mørksø ved åsen, og følte sig så grebet af dens melankolske karakter, at han, efter at være draget bort, kom igen tilbage og druknede sig her.''
[[Mørksøvej]] i den nordøstlige del af Virklund har navn efter Mørksø.