Oprindelsen til forleddet "Milling" er usikker. Men bækken har muligvis sit navn fra de små karpefisk, løjer, som lokalt kaldes millinger.
Den Millingbæk er således et vigtigt gydevandløb for ørred, milling og skalle. I forsommeren svømmer de op i vandløbet og lægger deres æg her, for siden at vende tilbage til Borre Sø.
